主题培训通知
1. 培训标题
单晶结构解析和晶体可视化培训
2. 主题背景和培训必要性
单晶结构解析是表征化合物结构最直观,也是最有效的手段之一。通过单晶结构解析可获得化合物的原子排列信息,能很好地揭示材料深层的结构与性能之间的关系,从而有助于获得重要的学术研究成果,发表高水平的学术论文。目前许多研究工作者,尤其是从事药物合成,配位化合物设计合成,光电磁新型晶态化合物等研究领域的,对晶体结构解析有重要需求。特别是对一些空间群难以确定、复杂无序、孪晶、手性绝对构型确定等较难解析的晶体结构束手无策。考虑到有些科研工作者对单晶解析感兴趣,又不太了解。本次培训将在介绍单晶解析理论基础上,分别介绍应用目前最新的图形界面化(GUI)程序包括Shelxl2016、Olex2、Sir2014等单晶结构解析程序解析单晶结构,运用包括最通用和经典的Direct Methods,Patterson Method两种算法以外,还包括最新发展的Charge Flipping,Intrinsic Phasing,Structure Expansion和Dual Space算法,展示最新算法在解析结构方面的优势。提供实例讲解解析晶体结构的完整过程,如何处理晶体无序、孪晶。如何利用 WinGX、Platon、Sir等程序辅助确定空间群、寻找栾晶矩阵、去除无法确定的溶剂衍射贡献等,以及如何进一步精修,利用Encifer完善CIF文件信息编辑,获得尽可能消除A、B类警告的checkcif报告,申请CCDC编号等满足文章发表的要求。最后讲解绘制酷炫的晶体晶胞图、画ORTEP图、堆积图等等,结合晶体学数据库包括CCDC、ICSD、Crystallography Open Database、Springer Materials的检索使用,对CIF结构信息进行有效的提取、分析与利用,晶体学各种数据格式之间的相互转化。通过本次培训,可以让学员掌握晶体结构解析技术,处理一些常见的晶体结构解析问题,满足日常的晶体结构解析需要,学会绘制晶体图,检索晶体数据库,对晶体结构信息进行有效利用与提取,发表高水平的学术论文。
3. 培训主要内容
1. 系统讲解晶体学基础;
2. 应用Shelxl2016程序解析单晶结构;
3. 应用Olex2程序解析单晶结构;
4. 应用Charge Flipping等新算法解析单晶结构;
5. 常见的晶体解析问题处理(无序、孪晶、去除溶剂衍射贡献等);
6. 如何完善CIF文件信息编辑,尽可能消除checkcif的A、B类警告;
7. 晶体图的绘制(晶胞图、ORTEP图、堆积图、氢键、π-π相互作用等);
8. 晶体数据库的检索与使用。
4. 涉及学科和研究领域
化学、材料、物理学科中凡与晶体结构有关的研究领域
5. 该培训拟提高学员如下方面的能力
1. 了解单晶以及单晶测试与解析基本方法;
2. 掌握Shelxl2016 单晶结构解析的基本方法和通用流程;
3. 掌握Olex2单晶结构解析的基本方法和通用流程;
4. 掌握Charge Flipping等新算法单晶结构解析的基本方法和通用流程;
5. 处理常见的单晶解析问题;
6. CIF文件信息编辑,获得尽可能消除A、B类警告的Checkcif文件,满足文章发表要求;
7. 掌握晶体图的绘制;
8. 晶体数据库的检索与使用。
6. 培训专家介绍
张老师:清华大学化学系无机化学博士
7. 培训日程表
注:
1. 实际培训安排可能有少许变动。
2. 学员需自带笔记本电脑。
3. 学员也可以提前将自己研究的相关数据,例子问题反馈给我们,我们制定相应的日程安排来完成这次培训。
第一天 | 8:30-9:00 | 学员注册报到,领取培训资料 |
9:00-9:50 | 晶体学基础 | |
9:50-10:00 | 茶歇 | |
10:00-11:20 | 单晶培养 | |
11:20-11:30 | 茶歇 | |
11:30-12:00 | 答疑与讨论 | |
12:00-13:30 | 午餐 | |
13:30-14:30 | 单晶测试 | |
14:30-14:40 | 茶歇 | |
14:40-16:10 | cif文件 | |
16:10-16:20 | 茶歇 | |
16:20-17:30 | 结构解析理论基础及算法 | |
17:30-18:00 | 答疑与讨论 | |
第二天 | 9:00-10:30 | 讲解Shelxtl各模块使用方法:XPREP, XS, XL, XP, XCIF |
10:30-10:40 | 茶歇 | |
10:40-12:00 | 实例讲解与实践训练,掌握Shelxtl 单晶结构解析的基本方法和通用流程 | |
12:00-13:30 | 午餐 | |
13:30-15:30 | 用XP画图(晶胞图、堆积图、ORTEP图等) | |
15:30-15:40 | 茶歇 | |
15:40-17:30 | 实例讲解与实践训练 | |
17:30-18:00 | 答疑与讨论 | |
第三天
| 9:00-10:30 | 使用Olex2及新算法Intrinsic Phasing进行晶体解析与精修 |
10:30-10:40 | 茶歇 | |
10:40-12:00 | 实例讲解与实践训练 | |
12:00-13:30 | 午餐 | |
13:30-15:30 | 无序、孪晶、去除溶剂衍射贡献等处理 | |
15:30-15:40 | 茶歇 | |
15:40-17:30 | 实例讲解与实践训练 | |
17:30-18:00 | 答疑与讨论 | |
第四天 | 9:00-10:30 | 其他辅助解析软件Platon, SIR, WinGX的运用 辅助寻找栾晶矩阵,确定空间群,空间群变换 |
10:30-10:40 | 茶歇 | |
10:40-12:00 | 实例讲解与实践训练 | |
12:00-13:30 | 午餐 | |
13:30-15:30 | 晶体可视化软件Diamond Mecurry的综合运用 | |
15:30-15:40 | 茶歇 | |
15:40-17:30 | 晶体学数据库的检索使用 | |
17:30-18:00 | 答疑与讨论 | |
培训结束 |
8. 培训时间/地点
时间:2017年4月27-30日(四整天)
地点:大连市,中国华录宾馆
9. 培训费用
RMB 5000 (包括培训费、餐费,不包含差旅及住宿费),限28人;
报名费可现场支付,若2017年4月17日前付款则只需支付RMB 4600。
10. 汇款账户
账户名:福州水草云信息咨询有限公司
账户:1402029109601062247
开户行:中国工商银行福州洪山支行
11. 报名参加
填写报名表(见下页),并发送到邮箱: service@shuicaoyun.com
或通过网站提交报名:www.shuicaoyun.com
12. 联系方式
Mobile: 15205019786赵女士
Email: service@shuicaoyun.com
水草云团队
2017年3月2日